Site Rengi

BilgiliUsta.com | Aradığınız Her Bilginin Adresi.

E. Coli Bakterisinde Kromozom Eşlenmesi

  • 10 Nisan 2021
  • E. Coli Bakterisinde Kromozom Eşlenmesi için yorumlar kapalı
  • 5 kez görüntülendi.
E. Coli Bakterisinde Kromozom Eşlenmesi

E.coli’deki replikasyon işlemi, oransal olarak, basit bir organizmanın bir kromozomunun kopyasını çıkarmak için gerekli olan bir dizi karışık basamaklar için hoş bir örnektir. Sentezin her bir basamağında çok yüksek özgüllükteki enzimler görev alır. Diğer pek çok enzimde olduğu gibi replikasyon enzimleri de DNA daki tanıma bölgelerinin üç boyutlu şekline ve polar yüklerine göre hareket etmektedirler. […]

E. Coli Bakterisinde Kromozom EşlenmesiE.coli’deki replikasyon işlemi, oransal olarak, basit bir organizmanın bir kromozomunun kopyasını çıkarmak için gerekli olan bir dizi karışık basamaklar için hoş bir örnektir. Sentezin her bir basamağında çok yüksek özgüllükteki enzimler görev alır. Diğer pek çok enzimde olduğu gibi replikasyon enzimleri de DNA daki tanıma bölgelerinin üç boyutlu şekline ve polar yüklerine göre hareket etmektedirler. DNA daki bağları ve uygun molekülleri yeniden düzenleyip, sonuçta bir ürün elde etmeye çalışırlar. Bu vaziyette, ürün dairesel bakteri kromozomunun bütün bir kopyasıdır. Karışık metabolik yollardaki enzimler hemen hemen eş zamanlı çalışırlar; fakat daha sarih olması açısından bu sentez sürecindeki hadiseleri ardarda işleyeceğiz.
1. E. coli’deki replikasyon işlemi DNA B isimli özgül bir proteinin kromozomun üzerinde yer alan ve kendine özgü baz dizilimi ile karakterize olan özel bir başlangıç noktasını tanıyıp, ona bağlanması ile başlar.
2. Daha sonra, DNA giraz DNA Gyrase olarak bilinen bir enzim grubu ya da topoizomerazlar bunlar DNA moleküllerinin şeklini değiştirip, kimyasal yapılarını bozmayan enzimlerdir DNA B proteinin her iki yanında hareket ederek kromozomun yoğun helezoni yapısını super coil gevşetir.
E. Coli Bakterisinde Kromozom Eşlenmesi3. İki DNA giraz molekülü başlangıç bölgesinden uzaklaştıkça iki molekül rep enzimi DNA’nın çift helezoni yapısını açar. Bu işlemde bazları bir arada yakalayan hidrojen bağlarının koparılmasında ATP’yi kullanır.
4. Daha sonra DNA daki tek zincirlere bağlanabilen proteinler Single Strand Binding=SSB iki zinciri birbirinden ayrı yakalayıp, hemen tekerrür birleşmesini engelleyecek bir yapı iskeleti kurar.
5. DNA replikasyonunun, başlamasından önce oluşması gerekli olan beş basamaktan sonuncusu ise primer sentezinden mesul olan primaz ismi verilen bir enzimin sisteme katılması ile başlar. Çünkü replikasyonu gerçekleştiren polimeraz enzimleri yalnızca çift zincirli; fakat sentezi tamamlanmamış bir zincirin ucuna kalıp zinciri okuyarak bazları ekleyebilir. Bu vaziyette DNA da açılan tek zincirlerin en azından minik bir bölgesinin çift zincirli olması gerekmektedir. Primaz başlangıç bölgesine bağlanıp primer denilen takribî on baz uzunlukta komplementer bir dizi ilaveler.
İşin garibi, bu primer RNA’dan yapılmıştır ve daha sonra DNA’ya dönüştürülmesi gerekir. Bu yer değiştirmenin nhakikat gerçekleştiğini ileride göreceğiz.
E. Coli Bakterisinde Kromozom Eşlenmesi6. Daha sonra birkaç proteinden oluşmuş bir kompleks olan DNA polimeraz III enzimi, zincire bağlanıp onu komplementer bazlarla replike etmeye başlar. İsmindan da anlaşıldığı gibi DNA nükleotitlerinden bir polimer meydana getirir. DNA polimeraz III enziminin kompleks bir yapıda olması gereklidir; çünkü bu enzim birçok değişik tepkime basamağını katalizlemek zorundadır ve kopya ettiği zincire bağlı olarak dört değişik nükleotiti substrat olarak kullanabilmelidir. Enzim yapısında, tahminen her biri adenin, guanin, sitozin ve timin için olmak üzere 4 aktif bölge vardır. Enzim kompleksi, kalıp zinciri okuyup komplementer nükleotiti yerine getirdiği anda, uzayan zincire nükleotitlerin bağlanmasınıda katalizler. Eklenen nükleotitler bu basamak için enerji sağlayan ATP’den gelen yüksek enerjili bir fosfat grubunun eklenmesi ile aktive olurlar. DNA polimeraz III, enzimatik özgüllüğü yüzünden nükleotitleri yalnızca nükleotit zincirinin fosfat içermeyen 3’ucuna ekleyebilir. Bu ciddi bir soruna neden olur. DNA çifte sarmalını n iki zinciri ters polaritelere sahip olduğundan biri 5′-3’doğrultusundayken, diğeri 3′-5’doğrultusunda ters yönlerde kopya edilmeleri gerekmektedir.
Rep enziminin DNA’yı açmasını takiben yalnızca bir zincir DNA polimeraz III ile kopya edilebilir. Öteki zincir bir şekilde ters yönde kopya edilir. Rep enzimini takiben DNA polimerazla oluşturulan DNA zinciri kesintisiz zincir leading strand, ters yönde sentezlenmekte olan DNA zinciri ise kesintili zincir “lagging strand” olarak bilinir. İlmeklerin geriye yavaş yavaş dikilmesiyle merdiven oluşturulur.
E. Coli Bakterisinde Kromozom Eşlenmesi7. Geri dikiş, primaz enzimin tek zincirli DNA boyunca kısa komplementer RNA nükleotitleri sentezlemesi ile başlar.
8. 5. basamakta oluşturulan kısa segmentler DNA polimeraz III için 3’serbest hidroksil uçlara sahiptir. Polimeraz buradan geriye doğru çalışır ve RNA primer segmentine ulaşana dek zinciri kopya eder. Bu vaziyette bir zincir kesintisiz kopya edilirken, diğeri bvefatlar halinde kopyalanır ve bu bvefatlara Okazaki fragmanları denir. Bunlar, 1000-2000 baz uzunluğundadır ve RNA primerleriyle birlikte bulunurlar.
9. Şimdi gizeme bir seri enzimin Okazaki fragmanlarını sürekli bir zincir oluşturacak şekilde birleştirmesine gelmiştir. Onarım kompleksinin hakikat enzimi olan DNA polimeraz I, 10 bazlık RNA primer segmentlerini uzaklaştırıp, yerine DNA’yı getirir.
10. Son olarak fragmanlar DNA ligaz ile birleştirilir ve yeni zincir tamamlanır.

ZİYARETÇİ YORUMLARI

Henüz yorum yapılmamış. İlk yorumu aşağıdaki form aracılığıyla siz yapabilirsiniz.

BİR YORUM YAZ